O Laboratório de Águas está estruturado em setores e laboratórios internos independentes, como se ilustra no esquema:

 

SECÇÃO de ANÁLISES Bacteriológicas

Neste sector realizam-se todos os ensaios microbiológicos e organolépticos, para as águas de consumo, naturais, piscinas e residuais.

Neste sector os ensaios biológicos de pesquisa de agentes biológicos.  
 

Laboratório de Microbiologia

O laboratório de microbiologia foi construído de forma a corresponder às mais recentes regras de funcionamento deste tipo de laboratórios, em particular na sua arquitetura e conceção que lhe permite assegurar o cumprimento da regra da marcha em frente assim como das condições ambientais específicas de trabalho.

Laboratório de Biologia

Este laboratório implementou, desde 1999, ensaios para as seguintes determinações para águas de consumo humano:

- Pesquisa e quantificação de Algas,
- Pesquisa e quantificação de Cianobactérias,
- Pesquisa e quantificação de protozoários.

 

SECÇÃO de ANÁLISES QuímicaS

Neste sector realizam-se os ensaios Físico-químicos, de parâmetros relativos a substâncias indesejáveis e a substâncias tóxicas, de água de consumo humano, naturais e residuais.
 

Laboratório de Química

Este laboratório é constituído por uma sala ampla, em que se realizam técnicas de química clássica e alguns métodos instrumentais, como cromatografia iónica. 
 

Laboratório de Absorção Atómica/Cromatografia

Neste laboratório encontram-se os equipamentos de:

- Absorção Atómica,
- Cromatografia Líquida,
- Cromatografia Gasosa